Las Instituciones fundantes que crearon la Fundación Educativa Santo Domingo y que hacen parte, a través de sus representantes, del Patronato de la FESD son seis.
- Provincia Hispania, Orden de Predicadores -frailes dominicos-
- Vicariato de España de la Provincia de Nuestra Señora del Rosario, Orden de Predicadores -frailes dominicos-
- Congregación de Santo Domingo
- Misioneras Dominicas del Rosario
- Dominicas Misioneras de la Sagrada Familia
- Provincia Rosa de Santa Eugenia - Dominicas de la Anunciata
A ellas se añadieron otras cuatro que decidieron incorporar alguno de sus colegios a la Fundación.
- Misioneras de Santo Domingo
- Sagrada Familia de Burdeos
- Siervas de María de Anglet
- Hermanas de la Presentación de la Virgen María